대한의학회는 3월 26일 밀레니엄 서울힐튼호텔에서 2013년도 정기총회 및 평의원회를 개최하고 2013년도 사업계획(안)과 예산(안)을 비롯한 주요 안건을 심의하고 의결하였다. 전년도 보다 3천여만 원이 인상된 18억 5천여만 원의 2013년도 예산안을 확정하였으며 학회 임원아카데미를 확대 개편하는 등 회원학회를 육성하고 소통을 강화하는 사업을 추진하기로 하였다. 정관 상의 일본식 표현인 “본 회”를 국문 표현인 “이 회”로 변경하고 대한의학회 정관 상의 약칭을 “본회”에서 “의학회”로 변경하였다. 또한 회원학회 학회 명칭 개정에 따라 “대한기생충학회”는 “대한기생충학·열대의학회”로, “대한마취과학회”는 “대한마취통증의학회”로 명칭을 변경하였다. 대한의학회 기획조정위원회와 대한의학학술지편집인협의회(학술지 심사) 그리고 이사회의 인준 심사를 통과한 대한두통학회와 대한청각학회를 대한의학회 신규 회원학회로 인준하였다. 이로서 대한의학회에는 154개 학회가 회원학회 명단에 등재되었다. 대한의학회는 정관 제10조(임원의 선출) 제1항에 따라 이왕준(명지의료재단 이사장, 청년의사 발행인) 이사를 정책이사로 인준하였으며 임기는 2015년 3월 31일까지로 하였다. 대한의사협회 정관 제24조와 대한의학회 정관 제21조에 의하여 34개 평의원회 구성 학회에서 추천한 신임 대의원 후보자 11명과 의학회 이사회에서 추천한 신임 대의원 후보자 16명, 교체대의원 후보자 8명을 의협 파견 대의원으로 선출하였다. 2012년 한해 동안 가장 모범적인 학술활동을 한 대한영상의학회에 “의학학회 대상(최우수상)”을, 대한결핵및호흡기학회, 대한당뇨병학회, 대한류마티스학회, 대한병리학회, 대한상부위장관·헬리코박터학회, 대한소화기기능성질환ㆍ운동학회, 대한신경과학회, 대한신경정신의학회, 대한심장학회, 대한안과학회, 대한외과학회, 대한이비인후과학회, 대한재활의학회, 대한정신약물학회, 대한진단검사의학회, 대한피부과학회, 대한핵의학회, 한국지질·동맥경화학회에 “의학학회 대상(우수상)”의 영예가 주어졌다. 또한 학술활동 성취도가 전년도에 비해 월등히 향상된 대한감염학회, 대한내시경복강경외과학회, 대한슬관절학회, 대한의학레이저학회, 대한해부학회에 “의학학회 대상(장려상)”이 주어졌다. 의학발전의 기반이 되는 학회의 육성과 발전에 헌신하고 봉사하신 분들의 업적을 기리기 위해 대한의학회는 2008년 11월부터 『명예의 전당』을 운영하고 있다. 올해는 김광우, 김동익, 김홍기, 이주걸 교수를 제5호 등재자로 선정했다. 대한의학회는 홈페이지에 명예의 전당 코너를 마련하여 헌정 되신 분들의 업적과 관련 자료를 소개하고 있다.